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甲状腺ホルモンが欠乏する甲状腺機能低下症の特徴は、不活発、あるいは代謝の低下である。脳下垂体の病気が原因のこともあり、また甲状腺そのものの病気が原因のこともある。以前、アメリカの五大湖や内陸の山岳地帯でみられた甲状腺腫は、食事にふくまれるヨード不足がおもな原因となって、甲状腺機能低下症をおこしていたためとされている。いまでは予防のため食卓塩にヨードが添加されるようになっている。クレチン症という先天性甲状腺機能低下症は、遺伝的に甲状腺機能に欠陥のある病気で、およそ数千人に1人の割合で生まれる。
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